As clamídias são bactérias intracelulares obrigatórias, desenvolvendo-
se na célula hospedeira e formando inclusões citoplasmáticas. Clamídia
tracomatis é responsável por infecções sexualmente transmissíveis
(uretrites e cervicites), podendo evoluir, quando não tratadas, para
infecções profundas (epididimite, salpingite, peri-hepatite,
esterilidade tubária), responsável igualmente por conjuntivites e
pneumonia no recém-nascido. Pode apresentar-se de forma assintomática
em 70% das mulheres e 30% dos homens. A PCR é útil na detecção rápida
das infecções (em diversos sítios) por Chlamydia trachomatis. Tem
sensibilidade e especificidade superiores à cultura e
imunofluorescência direta. Uma de suas principais vantagens é a
possibilidade de ser realizada também em amostras de urina, ao invés
do raspado uretral. De acordo com o CDC (Centro de Controle e
Prevenção de Doenças), a PCR é considerada o teste de escolha para
este diagnóstico