A dosagem do C1q é utilizada para a detecção de deficiência ou consumo de C1q e avaliação da via clássica do complemento. Encontra-se diminuída em doenças autoimunes (lupus eritematoso sistêmico em atividade, vasculites urticariformes, crioglobulinemias, etc.), processos infecciosos, hipogamaglobulinemia associada ao X, e imunodeficiência severa combinada. Uma limitação do exame é o fato de sua detecção poder ser encontrada sem que isso signifique processo de doença. Embora rara, é possível a ocorrência de deficiência genética do C1q