O gene BCL6 encontra-se localizado em 3q27. O rearranjo deste gene pode ser encontrado em 30-40% dos linfomas de células B e em 5-15% de linfomas foliculares. O FISH é realizado em cortes histológicos utilizando dupla coloração para o gene BCL6.
O rearranjo BCL6 é considerado NEGATIVO quando os sinais vermelho e verde apresentam-se com distância menor que o tamanho de dois sinais ou quando estão fundidos.
O rearranjo BCL6 é considerado POSITIVO quando as células analisadas apresentam o sinal verde e vermelho separados por uma distância maior que o tamanho de dois sinais