A interpretação dos esfregaços baseia-se em aspectos morfológicos previamente conhecidos. Alguns aspectos morfológicos de graduação das lesões dependem (até certo ponto) de interpretação subjetiva.
Principais aplicações clínicas: O exame visa detectar lesões de natureza pre-maligna e maligna do pulmão. E possível também diagnosticar: Agentes infecciosos, tais como bactérias, fungos, parasitas e vírus; Processos proliferativos benignos; Anormalidades epiteliais benignas dos epitélios escamoso e simples; Alterações epiteliais ocasionadas por agressão ao epitélio, radioterapia